GPSAdb

GPSAdb is a powerful platform that aims to assist life science researchers to easily access and analyze public perturbed data and explore differential gene expression data in depth. The current version of GPSAdb collected 3048 RNA-seq datasets associated with 1458 genes, which were knocked out/down by siRNA, shRNA, CRISPR/Cas9, or CRISPRi.GPSAdb是一款功能强大的科研平台，旨在助力生命科学领域研究者便捷获取与分析公共扰动数据集，并深入挖掘差异基因表达数据。当前版本的GPSAdb已收录3048组RNA测序（RNA-seq）数据集，涉及1458个经siRNA、shRNA、CRISPR/Cas9或CRISPRi完成敲除/敲低的基因。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

GPSAdb 2.0是一个综合性开放资源数据库，专注于人类细胞系中基因扰动转录组数据的探索与分析。它包含7,665个扰动组、覆盖2,810个靶基因和1,063个细胞系的42,235个RNA-seq样本，并提供Browse、Query、BioTrigger和fastGPSA等工具，支持用户深入挖掘差异基因表达数据并识别上游调控因子。