植物不同组织器官感知与传递紫外光信号的蛋白质机器的研究数据
收藏国家基础学科公共科学数据中心2024-03-05 收录
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资源简介:
本数据集采集于厦门大学生命科学学院,数据量约为100M。利用针对拟南芥不同组织器官发育的紫外光照实验体系,结合拟南芥幼苗的RNA-seq数据分析,鉴定到依赖于UV-B光来调控拟南芥子叶生长发育的转录因子MYB13。通过构建myb13的突变体及MYB13-FLAG的转基因材料,发现MYB13为拟南芥子叶增大和胁迫适应的正调控因子。并通过多种生物化学和分子生物学等实验手段,检测到MYB13调控生长素应答基因和花青素合成基因的表达,UVR8与MYB13相互作用并调控MYB13的DNA结合活性,揭示了UV-B光受体在亚细胞水平介导植物子叶发育及紫外光胁迫适应的分子机制;利用酵母双杂交实验筛选到HY5的互作因子RUP1,通过多种实验手段检测到RUP1及其同源蛋白RUP2为CUL4-DDB1 E3泛素连接酶复合体的底物受体蛋白并介导HY5的降解,COP1通过与RUP1/2结合并促进RUP1/2的降解来间接稳定HY5,揭示了UV-B光信号因子拮抗调控植物下胚轴发育的分子机制;同时,在酵母系统中组装UV-B光信号核心复合体及蓝光信号核心复合体,利用该复合体调控染色质长距离相互作用,开发基因表达调控工具。
提供机构:
厦门大学
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集来自厦门大学生命科学学院,包含约73.47MB的数据文件,基于拟南芥紫外光照实验和RNA-seq分析,鉴定了调控子叶发育的转录因子MYB13,并揭示了UVR8与MYB13相互作用、RUP1/2介导HY5降解等分子机制,同时开发了基因表达调控工具。
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