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化合物活性数据库(HIV)

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国家基础学科公共科学数据中心2024-03-05 收录
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资源简介:
化合物活性数据库系统始建于2003年,主要用于新药新化合物的研究与创制。目前,世界上有许多实验室中的许多人在从事化合物结构-活性/性质的相关性(QSAR/QSPR)研究,其课题方向主要集中于新药的创制。一种新药的研究,主要历经合成、活性测试和临床试验的过程。在没有先验知识的情况下,合成需要“穷举”,非常费时。在活性数据库的基础上,可由计算机首先构造一个对未知化合物进行活性预测的数学模型,能够节省很多人力物力。为了适应该类研究的需要,我们所建造的活性数据库主要包括:化合物美国化学文摘社的登录号即CAS RN,化合物名称,分子式,分子量,化合物的结构信息,与活性值相关的数据等。其中,CAS RN不仅可以用于活性数据库的检索,尚可用于与其它数据库如红外光数据库、质谱数据库和碳13NMR数据库的通讯。和结构相关的信息包括两种存储形式:化合物结构三维坐标信息和化合物结构的二维连接表。三维坐标信息可以用于化合物在屏幕上进行三维结构的显示;借用二维连接表运用一定的算法,则可衍生拓扑指数等。所谓拓扑指数,是一种图的不变量,该种数学量与结构中结点的编码顺序关,可由结构图所衍生。拓扑指数是在QSAR/QSPR研究中应用最广泛的一种参数,因为:一种拓扑指数可直接由结构所得;衍生拓扑指数的方法一般比较简单;更重要的是常可得到比较好的结果。因而,结构的二维连接表是该数据库中很重要的内容。目前,我们的系统可提供单项检索和多项的联合检索;具备概要输出和详细两种输出方式;可进行三维结构显示,等
提供机构:
中国科学院长春应用化学研究所
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