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OBIS海洋物种观测数据集由全球20多个OBIS节点连接500个机构提供，包含超过4500万条观测记录，涵盖了近12万种海洋物种。数据集的目标包括提供全面的科学知识库、促进生物地理和环境数据整合、支持全球海洋生物多样性监测、为政策制定提供信息、支持海洋空间规划、增强机构能力、提供教育和研究支持以及促进国际合作。数据集字段包括物种的唯一标识符、经纬度、时间戳、科学名称、深度信息、环境参数等。

The OBIS Marine Species Observation Dataset is provided by 500 institutions from 56 countries connected through 20 OBIS nodes worldwide. It includes over 45 million observations of nearly 120,000 marine species ranging from bacteria to whales. The dataset aims to provide a comprehensive scientific knowledge base, facilitate biogeographic and environmental data integration, support global marine biodiversity monitoring, and more. The dataset fields include globally unique identifiers, longitude and latitude, timestamps, scientific names, depths, environmental parameters, and all fields are parsed and validated by OBIS.

原始信息汇总

OBIS Marine Species Observation Dataset

数据集描述

• 名称: OBIS Marine Species Observation Dataset
• 许可证: cc-by-nd-4.0
• 语言:
  • 英语 (en)
  • 拉丁语 (la)
• 标签:
  • OBIS
  • biology
  • marine
  • sealife
  • sea
• 大小类别: 100M<n<1B
• 任务类别:
  • time-series-forecasting
  • tabular-regression
  • tabular-classification

数据集字段

字段名	备注
id	由OBIS分配的全局唯一标识符。
dataset_id	由OBIS分配的内部数据集标识符。
decimalLongitude	由OBIS解析和验证。
decimalLatitude	由OBIS解析和验证。
date_start	基于eventDate（开始）的Unix时间戳。
date_mid	基于eventDate（中间）的Unix时间戳。
date_end	基于eventDate（结束）的Unix时间戳。
date_year	基于eventDate的年份。
scientificName	基于scientificNameID或通过与WoRMS匹配提供的scientificName的有效科学名称。
originalScientificName	提供的scientificName。
minimumDepthInMeters	由OBIS解析和验证。
maximumDepthInMeters	由OBIS解析和验证。
coordinateUncertaintyInMeters	由OBIS解析和验证。
flags	由OBIS添加的质量标志。质量标志在此处记录。
dropped	由OBIS质量控制丢弃的记录？
absence	缺失记录？
shoredistance	由OBIS质量控制添加的离岸距离（米），基于OpenStreetMap。负值表示观测点在内陆，距离为-1倍。
bathymetry	由OBIS添加的测深数据。测深值基于EMODnet Bathymetry和GEBCO，参见数据参考。
sst	由OBIS添加的海表温度。sst值基于Bio-Oracle，参见数据参考。
sss	由OBIS添加的海表盐度。sss值基于Bio-Oracle，参见数据参考。
marine	基于WoRMS的海洋环境标志。
brackish	基于WoRMS的半咸水环境标志。
freshwater	基于WoRMS的淡水环境标志。
terrestrial	基于WoRMS的陆地环境标志。
taxonRank	基于WoRMS。
AphiaID	基于scientificNameID或通过与WoRMS匹配提供的scientificName的有效名称的AphiaID。
redlist_category	IUCN红色名录类别。
superdomain	基于WoRMS。
domain	基于WoRMS。
kingdom	基于WoRMS。
subkingdom	基于WoRMS。
infrakingdom	基于WoRMS。
phylum	基于WoRMS。
phylum (division)	基于WoRMS。
subphylum (subdivision)	基于WoRMS。
subphylum	基于WoRMS。
infraphylum	基于WoRMS。
parvphylum	基于WoRMS。
gigaclass	基于WoRMS。
megaclass	基于WoRMS。
superclass	基于WoRMS。
class	基于WoRMS。
subclass	基于WoRMS。
infraclass	基于WoRMS。
subterclass	基于WoRMS。
superorder	基于WoRMS。
order	基于WoRMS。
suborder	基于WoRMS。
infraorder	基于WoRMS。
parvorder	基于WoRMS。
superfamily	基于WoRMS。
family	基于WoRMS。
subfamily	基于WoRMS。
supertribe	基于WoRMS。
tribe	基于WoRMS。
subtribe	基于WoRMS。
genus	基于WoRMS。
subgenus	基于WoRMS。
section	基于WoRMS。
subsection	基于WoRMS。
series	基于WoRMS。
species	基于WoRMS。
subspecies	基于WoRMS。
natio	基于WoRMS。
variety	基于WoRMS。
subvariety	基于WoRMS。
forma	基于WoRMS。
subforma	基于WoRMS。

数据集目标

1. 提供全面的科学知识库。
2. 促进生物地理和环境数据的整合。
3. 支持全球海洋生物多样性监测。
4. 为政策制定提供信息。
5. 支持海洋空间规划。
6. 增强机构和专业能力。
7. 提供教育和研究支持。
8. 促进国际合作。

引用

BibTeX @misc{HFforLegal2024, author = {Louis Brulé Naudet}, title = {OBIS Marine Species Observation Dataset}, year = {2024} howpublished = {url{https://huggingface.co/datasets/louisbrulenaudet/obis}}, }

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

OBIS海洋物种观测数据集是全球最大的海洋生物多样性数据库之一，整合了来自500多个机构的4500多万条观测记录，涵盖近12万种海洋生物。数据集提供了物种的科学名称、分类信息、地理位置、深度、时间以及环境参数（如海表温度和盐度），并支持多种数据格式和语言，旨在支持科学研究、政策制定和海洋保护。