Domain Interaction Graph Guided ExploreR

DIGGER is an essential resource for studying the mechanistic consequences of alternative splicing such as isoform-specific interaction and consequence of exon skipping. The database integrates information of domain-domain and protein-protein interactions with residue-level interaction evidence from co-resolved structures. DIGGER allows users to seamlessly switch between isoform and exon-centric views of the interactome and to extract sub-networks of relevant isoforms (isoforms specific PPIs).

DIGGER是研究可变剪接（alternative splicing）机制性后果的关键资源，可用于探究剪接异构体（isoform）特异性相互作用以及外显子跳跃（exon skipping）所带来的相关后果。该数据库整合了结构域-结构域相互作用与蛋白质-蛋白质相互作用的相关信息，这些相互作用均带有来自共解析结构的残基级相互作用证据。DIGGER支持用户在相互作用组（interactome）的异构体视角与外显子为中心的视角之间无缝切换，并可提取相关剪接异构体的子网络（即异构体特异性蛋白质-蛋白质相互作用）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

DIGGER是一个整合蛋白质相互作用和结构域相互作用的数据库，通过映射相互作用残基到外显子，支持异构体和外显子层面的交互分析。它提供多种分析模式，包括网络级子网络构建，并集成了NEASE工具用于可变剪接事件的功能富集分析。该资源旨在帮助研究可变剪接的机制影响，如异构体特异性相互作用和外显子跳跃的后果。