tyang816/MetalIonBinding_ESMFold
收藏Hugging Face2024-07-08 更新2024-06-12 收录
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资源简介：
金属结合蛋白数据集（MetalIonBinding Dataset）包含能够螯合金属离子的蛋白质或蛋白质域的信息。数据集包含两种标签，问题类型为单标签分类。数据列包括蛋白质氨基酸序列（aa_seq）、Foldseek 20 3di结构序列（foldseek_seq）、DSSP 8二级结构序列（ss8_seq）、DSSP 3二级结构序列（ss3_seq）以及由VQ-VAE编码的ESM3结构序列（esm3_structure_seq）。
金属结合蛋白数据集（MetalIonBinding Dataset）包含能够螯合金属离子的蛋白质或蛋白质域的信息。数据集包含两种标签，问题类型为单标签分类。数据列包括蛋白质氨基酸序列（aa_seq）、Foldseek 20 3di结构序列（foldseek_seq）、DSSP 8二级结构序列（ss8_seq）、DSSP 3二级结构序列（ss3_seq）以及由VQ-VAE编码的ESM3结构序列（esm3_structure_seq）。
提供机构：
tyang816
原始信息汇总
MetalIonBinding Dataset with ESMFold Structural Sequence
描述
- Metal-binding proteins are proteins or protein domains that chelate a metal ion.
数据集信息
- Number of labels: 2
- Problem Type: single_label_classification
- Columns:
- aa_seq: protein amino acid sequence
- foldseek_seq: foldseek 20 3di structural sequence
- ss8_seq: DSSP 8 secondary structure sequence
许可
- License: apache-2.0
任务类别
- task_categories: text-classification
标签
- tags:
- protein
- downstream task
