转录组信息原始数据集
收藏国家基础学科公共科学数据中心2026-01-30 收录
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https://nbsdc.cn/general/dataDetail?id=67279ee4195d2629e8afecf1&type=1
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资源简介:
非编码RNA介导的基因沉默中关键蛋白质机器的变化或缺失,会造成全基因组层面基因沉默现象的异常,包括反常活化和反常沉默等,鉴定这些蛋白质机器是本项目的中研究内容。这些基因沉默异常的现象,通常需要利用全基因组转录组分析来鉴定基因表达的变化。本数据集元数据主要是本项目开展过程中产生的转录组分析数据。数据主要在项目执行期内(2016年至2018年间)产生,采集地点为中国科学院上海植物逆境生物学研究中心基因组学平台,设备为Illumina HiSeq2000根据总RNA完整性、各测序位置碱基比率、接头序列出现比例、测序数据冗余率和比对率、RNA双端完整度等参数对数据质量进行全程监控,确保重转录组测序数据的质量。
提供机构:
中国科学院分子植物科学卓越创新中心



