HISSTA

HISSTA is a comprehensive database for archiving and analyzing in situ spatial transcriptome data at single-cell resolution from human tissues. It integrates datasets generated by MERFISH, CosMx SMI, and Xenium, offering interactive tools for cell type annotation, spatial communication, and niche analysis across 28 million cells and 112 samples.HISSTA是一款用于归档、分析人类组织单细胞分辨率（single-cell resolution）下原位空间转录组数据（in situ spatial transcriptome data）的综合型数据库。该数据库整合了由MERFISH、CosMx SMI及Xenium生成的多套数据集，涵盖2800万个细胞与112个样本，并提供用于细胞类型注释（cell type annotation）、空间通讯（spatial communication）以及微环境分析（niche analysis）的交互式分析工具。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

HISSTA是一个人类原位单细胞转录组图谱数据库，整合了来自16种人类组织、超过2800万个细胞的MERFISH、CosMx和Xenium平台的空间转录组数据。该数据库提供细胞类型注释、空间共定位、细胞通讯和生态位分析等交互式工具，支持用户进行深入的空间上下文分析。