The Complete Genome Map of Eryngium foetidum L. Provides Insights into Genome Evolution and Aroma Formation

基因组测序和高质量的完整端粒对端粒（T2T）基因组组装Eryngium foetidum 。组装后的基因组包括一个核基因组（498.35 Mb）、一个叶绿体基因组（155.27 kb）和一个线粒体基因组（241.66 kb）。基因组注释显示重复序列含量较高（55.30%），其中长末端重复（LTR）逆转录转座子最为丰富（24.51%），蛋白质编码基因为38,324个。比较基因组分析表明E. foetidum共享两个全基因组复制（WGD）事件 伞形科 。从系统发育上看，它在科内处于基层位置，估计分化时间约为6687万年前。综合挥发性代谢组学（GC-MS）和转录组分析鉴定了不同组织中1304种挥发性有机化合物（VOCs），其中萜烯类（23.46%）和酯类（17.33%）为主导香气成分，尤其在花朵和根部中表现突出。关键萜烯类生物合成基因的扩展和表达提升，尤其是萜烯合成酶-a（TPS-a）和TPS-b特有的气味密切相关E. foetidum。此外，共表达网络分析显示TF（如MYBs、ERFs）在萜类生物合成途径中具有潜在调控作用。本研究为阐明E. foetidum分子育种和次级代谢研究提供了理论见解Apiaceae植物