PaHMM_Tree_Based系统发育树估算方法与基准测试补充数据

本数据集为系统发育树估算方法研究的补充资料，包含PaHMM-Tree（一种无需单一比对的邻接法）的开发及基准测试结果。通过模拟数据对比该方法与传统两步法（多序列比对+树推断）、无比对距离法的性能，分析不同序列分歧度下各方法的准确性差异，是进化生物学与生物信息学研究的参考数据。 论文“Phylogenetic tree estimation with and without alignment: new distance methods and benchmarking”