转录组与代谢物关联分析
收藏国家林业和草原科学数据中心2025-09-08 更新2025-10-11 收录
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资源简介：
将心材和过渡区的转录组和代谢组测定结果进行联合分析，首先通过 Pearson 相关性分析计算差异表达基因（DEGs）与差异代谢物（DMs）间的表达量相关性系数，筛选出显著相关（P<0.05 且 | r|>0.8）的基因 -代谢物对；随后基于 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）数据库，对这些关联的基因和代谢物进行通路富集分析，重点聚焦与心材形成相关的木质素合成、黄酮类物质代谢、激素信号传导等通路；同时构建基因-代谢物共表达网络，通过模块划分与核心节点分析，挖掘调控心材发育关键通路的核心基因及其对应的特征代谢物。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2025-09-08
