DykeF/NCTCRCHE100K

这是一个包含100,000个非重叠图像块的数据集，这些图像块来自人类结直肠癌和正常组织的H&E染色组织学图像。所有图像均为224x224像素，每个像素代表0.5微米，并使用了Macenko方法进行颜色归一化。组织类别包括：脂肪组织（ADI）、背景（BACK）、碎片（DEB）、淋巴细胞（LYM）、粘液（MUC）、平滑肌（MUS）、正常结肠粘膜（NORM）、癌症相关基质（STR）、结直肠腺癌上皮（TUM）。这些图像是从N=86个H&E染色的人类癌症组织切片中手动提取的，这些切片来自NCT生物库（德国海德堡国家肿瘤疾病中心）和UMM病理档案（德国曼海姆大学医学中心）。组织样本包括CRC原发肿瘤切片和CRC肝转移肿瘤组织；正常组织类别通过增加非肿瘤区域的胃切除标本以增加变异性。数据集分为训练集（100,000个“train”和100,000个“train_nonorm”样本）以及验证集（7,180个样本）。

原始信息汇总

NCTCRCHE100K 数据集卡片

描述

这是一个包含100,000张非重叠的从人源结直肠癌（CRC）和正常组织中提取的苏木精和伊红（H&E）染色组织学图像的集合。所有图像的尺寸为224x224像素，分辨率为0.5微米每像素（MPP）。所有图像均使用Macenko方法进行颜色归一化。

组织类别包括：脂肪（ADI）、背景（BACK）、碎片（DEB）、淋巴细胞（LYM）、粘液（MUC）、平滑肌（MUS）、正常结肠粘膜（NORM）、癌相关基质（STR）、结直肠腺癌上皮（TUM）。

这些图像是从N=86张H&E染色的人源癌症组织切片中手动提取的，这些切片来自甲醛固定石蜡包埋（FFPE）样本，来自NCT生物库（国家肿瘤疾病中心，海德堡，德国）和UMM病理档案（曼海姆大学医学中心，曼海姆，德国）。组织样本包含CRC原发性肿瘤切片和来自CRC肝转移的肿瘤组织；正常组织类别通过增加来自胃切除标本的非肿瘤区域来增加变异性。

数据结构

数据集分为训练集（100,000个“train”和100,000个“train_nonorm”样本）以及7180个样本的验证集。