RGAP
收藏国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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资源简介：
RGAP includes 16 whole genome rice assemblies and sequence variants generated from multiple rice pan-genome projects including the 3000 Rice Genomes Project. We updated gene expression abundance data with 80 RNA-sequencing datasets and to facilitate gene function discovery, performed gene coexpression resulting in 39 coexpression modules that capture highly connected sets of co-regulated genes.
RGAP 包含16份水稻全基因组组装结果，以及来自多个水稻泛基因组项目的序列变异数据，其中涵盖3000水稻基因组项目（3000 Rice Genomes Project）。本数据集依托80套RNA测序（RNA-sequencing）数据集更新了基因表达丰度数据；为助力基因功能发掘研究，还开展了基因共表达分析，最终得到39个共表达模块，这些模块可捕获高度关联的共调控基因集合。
提供机构：
University of Georgia
创建时间：
2018-01-26
搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
RGAP数据集是一个专注于水稻基因组注释的资源，提供了包括39,049个非转座子基因和16,937个转座子基因在内的总计55,986个基因位点的详细注释。该数据集通过基因组浏览器和多种搜索工具支持研究人员进行基因序列、功能和结构分析，并定期更新以保持数据的现代性和安全性。
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