马尾松转录组密码子使用偏好性及其影响因素
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资源简介：
利用CodonW，EMBOSS密码子分析软件对马尾松转录组进行密码子参数分析和密码子偏好性分析，根据中性绘图、ENc-GC3s、偏倚性分析推测马尾松密码子偏好性的主要形成原因。通过比较高低表达基因样本同义密码子相对使用度(RSCU)筛选马尾松最优密码子，通过密码子使用频率比值分析马尾松与拟南芥、烟草、欧洲山杨、大肠杆菌、酿酒酵母的密码子偏好性差异。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心创建时间：
2022-11-01
搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
该数据集针对马尾松转录组，利用CodonW和EMBOSS等软件分析了密码子使用偏好性及其影响因素，包括通过中性绘图等方法探究形成原因，并筛选了最优密码子。同时，研究还比较了马尾松与拟南芥、烟草等多个物种在密码子偏好性上的差异。
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