Canadian VirusSeq Data Portal

The goal of the CanCOGeN VirusSeq project is to sequence up to 150,000 viral samples from Canadians testing positive for COVID-19. The VirusSeq Data Portal is an open-source and open-access data portal for all Canadian SARS-CoV-2 sequences and associated non-personal contextual data. It harmonizes, validates and automates submission to international databases.

CanCOGeN病毒测序（CanCOGeN VirusSeq）项目的目标是对最多15万份来自新型冠状病毒肺炎（COVID-19）检测呈阳性的加拿大民众的病毒样本进行测序。VirusSeq数据门户是一个开源且开放获取的数据门户，收录所有加拿大来源的严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）序列及其关联的非个人化背景数据。该门户可实现数据标准化整合、质量验证，并自动完成向国际数据库的提交流程。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集源自加拿大VirusSeq数据门户，现已扩展为iMicroSeq数据门户，专注于整合病毒、细菌等微生物数据，包括临床和环境数据。它提供大量病毒基因组文件，用于支持公共卫生决策、疫苗开发和疾病监测等分析。