scQTLbase

scQTLbase is the first integrated human single-cell eQTL (sc-eQTL) portal, featuring 304 datasets across 57 cell types and 95 cell states. It includes approximately 16 million SNPs significantly associated with cell-type/state gene expression and 0.69 million disease-associated sc-eQTLs from 3,333 traits/diseases.scQTLbase是首个整合型人类单细胞表达数量性状基因座（single-cell eQTL, sc-eQTL）综合门户数据库，收录了覆盖57种细胞类型、95种细胞状态的304个数据集。该数据库包含约1600万个与细胞类型或细胞状态下基因表达显著相关的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP），以及源自3333种性状与疾病的69万个疾病关联sc-eQTL。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scQTLbase是首个集成的人类单细胞eQTL门户，涵盖304个数据集、57种细胞类型和95种细胞状态，包含约1600万与基因表达相关的SNP和约69万疾病相关sc-eQTL。该数据库提供搜索、可视化等功能，支持疾病易感基因的发现。