sc2GWAS

sc2GWAS curates 15 078 310 candidate GWAS trait–cell regulatory pairs from > 6 300 000 individual scRNA-seq cells, applies strict QC on both scRNA-seq and GWAS datasets, and provides ranked lists of trait-relevant genes plus extensive genetic and epigenetic annotations. The platform supports trait/disease, cell-type and gene-based queries, online enrichment analyses (MAGMA, cell-type, trait-gene), interactive visualizations and bulk downloads—facilitating discovery of trait-cell-gene mechanisms.sc2GWAS 从超过630万个单个单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）细胞中整理得到15078310个候选的全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study, GWAS）性状-细胞调控对，同时对scRNA-seq与GWAS数据集实施严格的质量控制（Quality Control, QC），并提供性状相关基因的排序列表以及丰富的遗传与表观遗传注释信息。该平台支持针对性状/疾病、细胞类型以及基因的查询，提供在线富集分析（涵盖MAGMA、细胞类型富集、性状-基因富集分析）、交互式可视化功能与批量下载服务，助力性状-细胞-基因调控机制的研究与发现。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

sc2GWAS 是一个综合性平台，旨在整合单细胞RNA测序与GWAS数据，整理了超过1,500万个GWAS性状-细胞候选调控对，涵盖108种复杂性状。该平台通过严格的质量控制，提供丰富的遗传和表观遗传注释，并支持在线查询、富集分析和可视化功能，以促进性状-细胞-基因机制的探索。