<b>TWAS/PWAS gene expression prediction models</b>
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我们使用 Pain 等人描述的方法来计算 QTL 汇总数据的基因表达预测模型。简而言之，该方法使用八种领先的汇总统计方法（top1、PRS-CS、SBayesR、SBayesR-robust、DBSLMM、LDpred2、lassosum 和 SuSiE）计算十个 TWAS 预测模型。染色体位置基于 GRCh37，SNPID 基于 dbSNP 155。包括顺式基因区域 （eQTL 中基因的上游和下游 1 MB，pQTL 的 500 KB）。brain_PWAS_Wingo 等人。 —— PMID：37653343brain_PWAS_Yang 等人。 —— PMID：34239129brain_cell_TWAS_Fujita 等人。 —— PMID：38514782brain_cell_TWAS_Bryois 等人。 —— PMID：35915177brain_TWAS_Zeng 等人。 —— PMID：35058635brain_tissue_TWAS_Klein 等人。 —— PMID：36823318
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2024-12-23
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