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基于蛋白组约束的黑曲霉GSMM模型数据集

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国家基础学科公共科学数据中心2026-01-30 收录
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https://nbsdc.cn/general/dataDetail?id=67d50fff195d260905af9c70&type=1
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资源简介:
本数据集基于黑曲霉基因组规模代谢模型iHL1210,整合大规模酶动力学与蛋白质组学数据,构建了一种酶约束型代谢模型(GECKO)。通过引入酶丰度约束,模型显著提升了表型预测能力,并增强了对复杂生化现象模拟的可靠性。数据集结果表明,酶约束使40.1%的代谢反应通量变异性显著降低,同时模型在基因敲除模拟中展现出预测代谢表型变化的潜力。该数据集的实验可有效提升了黑曲霉代谢模型的系统水平分析能力,为黑曲霉的代谢特征表征以及基因靶点预测提供了可靠的数据支撑,具有重要的学术和应用价值。
提供机构:
华东理工大学
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