ECRbase

ECRbase features a database of syntenic blocks that recapitulate the evolution of rearrangements in vertebrates and a comprehensive collection of promoters in all vertebrate genomes generated using multiple sources of gene annotation.ECRbase 包含两类核心数据：其一为同线区块（syntenic blocks）数据库，可完整复现脊椎动物基因组重排的演化历程；其二为覆盖所有脊椎动物基因组、基于多源基因注释构建的全面启动子集合。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ECRbase是一个脊椎动物基因组数据库，主要包含进化保守区(ECRs)、启动子和转录因子结合位点。该数据库基于ECR Browser比对构建，涵盖了脊椎动物基因组中的同源区块和来自多种基因注释来源的启动子集合。