Georeferenced, dendrometric and genotypic data for 1333 Pinus nigra ssp. salzmannii trees from native populations in France and Europe
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https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/citation?persistentId=doi:10.57745/QTGYY8
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++++++++ English below +++++++++++ Le pin de Salzmann ( Pinus nigra ssp salzmannii) est une sous espèce de pin noir endémique en France et en Espagne, dont l'habitat est protégé dans le cadre de Natura 2000 (Habitat 9530 - Pinèdes (sub)méditerranéennes de pins noirs endémiques). Un programme de recherche a été porté en France à partir de 2008 par INRAE (Unité de recherches Ecologie des Forêts Méditerranéennes), sous l'égide de la région Occitanie (anciennement Languedoc-Roussillon), de l'Office National de Forêts, de la Commission Nationale Ressources Génétiques Forestières (https://crgf.inrae.fr/crgf/), pour caractériser la diversité génétique de ce taxon et en entreprendre la sauvegarde. Cette archive est constituée de deux séries de deux fichiers. La première série contient le fichier "Genotypes_data" et le fichier "Genotypes_metadata". Le fichier "Genotypes_data" contient les données de génotypage microsatellites (13 locus) d'arbres de l'espèce Pinus nigra et de ses sous-espèces, qui ont été utilisés pour caractériser l'originalité génétique du pin de Salzmann. Les 678 génotypes listés sont à la base des analyses de l'article "A comprehensive strategy for the conservation of forest tree genetic diversity: an example with the protected Pinus nigra subsp. salzmannii (Dunal) Franco in France.", par C. Scotti-Saintagne, A. de Sousa Rodrigues, A. Roig, B. Fady (INRAE, URFM, Avignon, France, soumis pour publication à la revue Conservation Genetics. Le fichier "Genotypes_metadata" renseigne l'intitulé des colonnes du fichier "Genotypes_data". La seconde série contient le fichier "Phenotypes_data" et le fichier "Phenotypes_metadata". Le fichier "Phenotypes_data" contient des données de localisation, de dendrologie et d'âge d'arbres de la sous-espèce Pinus nigra salzmannii, étudiés dans le même article soumis à Conservation Genetics pour leur valeur en conservation. Les intitulés des colonnes des 1333 individus listés sont décrits dans le fichier "Phenotypes_metadata".
提供机构:
Recherche Data Gouv
创建时间:
2023-04-07



