PhaSepDB

Phase separation PS proteins form droplets to regulate myriad membraneless organelles MLOs and cellular pathways such as transcription, signaling transduction and protein degeneration. With growing interest in PS condensates and associated proteins, we introduce PhaSepDB, which provides a collection of manually curated phase separation PS proteins and Membraneless organelles MLOs related proteins. As of June 2022, 1419 PS entries, 507 high throughput PS entries, 73 MLOs, 770 low throughput MLO related entries and 7303 high throughput MLO related entries were included.

相分离（Phase Separation, PS）蛋白通过形成凝聚液滴，调控众多无膜细胞器（Membraneless Organelles, MLOs）以及转录、信号转导、蛋白质变性等多种细胞通路。随着学界对相分离凝聚体及其相关蛋白的研究兴趣与日俱增，我们推出了PhaSepDB数据库。该数据库收录了经人工整理注释的相分离蛋白及无膜细胞器相关蛋白。截至2022年6月，该数据库已纳入1419条相分离蛋白条目、507条高通量相分离蛋白条目、73种无膜细胞器条目、770条低通量无膜细胞器相关蛋白条目以及7303条高通量无膜细胞器相关蛋白条目。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PhaSepDB是一个专注于蛋白质相分离和生物分子凝聚物的综合知识库，包含来自148个生物体的1,849个蛋白质的专家注释数据，数据来源于1,620篇出版物和9,523个实验。该数据库提供相分离特性、内在决定因素、外在调节因子等功能相关性的详细注释信息。