GabiPD

GabiPD是一个植物基因组数据库，专注于八种作物植物和模式植物拟南芥的蛋白质序列数据。该数据库提供蛋白质编码基因的蛋白质序列、cDNA序列和基因组序列，包括保守蛋白质结构域信息，并提供了JBrowser基因组浏览器用于可视化遗传数据。GabiPD is a plant genomics database that focuses on protein sequence data of eight crop plants and the model plant Arabidopsis thaliana. It provides protein sequences, cDNA sequences and genomic sequences of protein-coding genes, including information on conserved protein domains, and offers the JBrowser genome browser for visualizing genetic data.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

GabiPD是一个专注于八种作物植物和模式植物拟南芥的植物基因组数据库，提供蛋白质编码基因的序列数据、保守结构域信息以及JBrowse基因组浏览器可视化功能。该数据库还通过MCL算法对蛋白质进行聚类，以帮助用户查找不同植物间的同源蛋白。