拉萨汉族个体粪便代谢组数据

我们获取了拉萨80个汉族个体的粪便代谢组数据。使用含有同位素标记的内标混合物的1:1乙腈:甲醇溶液提取粪便代谢物。采用UHPLC-QTOF-MS/MS系统（Vanquish, Thermo Fisher Scientific, Bremen, Germany）进行分析。代谢物提取物的分离采用Waters Amide柱（2.1 mm × 100 mm, 1.7 μm）。注射2µL代谢物溶液，以a相（25 mmol/L乙酸铵和25 mmol/L氢氧化铵水溶液，pH = 9.75）和B相（乙腈）为流动相，流速0.5 mL/min进行洗脱。梯度如下:95% B 0-0.5 min，在0.5-7 min内从95%到65% B呈线性梯度，在7-8 min内从65%到40% B，在40% B下保持8-9 min，在9-9.1 min内从40%急剧增加到95% B，然后在95% B下保持9.1-12 min。代谢片段使用Q Exactive HFX质谱仪（Orbitrap MS, Thermo）结合电喷雾电离（ESI）获得。ESI源设置为:MS/MS分辨率7500，毛细管温度320℃，全质谱分辨率60000。离子喷雾浮电压（ISVF）在正模式下设置为3.5 kV，在负模式下设置为-3.2 kV。阳性模式下共检测到7059个峰，阴性模式下共检测到4599个峰。使用ProteoWizard（v3.0）将原始数据转换为mzXML格式，并使用R包XCMS进行峰检测、提取、对齐和集成21。使用公共数据库（METLIN, HMDB, KEGG, CHEBI, mzCloud, mzVault和脂质）进行代谢物注释，截断值为0.3，并根据LC-MS/MS评分过滤重复。本数据集可以用来研究高原汉族人群在高原低氧环境下的肠道代谢特征。