Abalone sequencing and variant discovery

raw sequence and variant files from genome sequencing of Abalone species.Lineage: 100bp PE illumina sequence from abalone species; green lip, black lip and a hybrid cross aligned to abalone genome using BWA. Variants called using GATK tools.

本数据集包含鲍鱼（Abalone）物种基因组测序所得的原始测序序列文件与变异位点文件。测序数据详情：采用Illumina平台进行100bp双端（PE, Paired-End）测序，涵盖绿唇鲍、黑唇鲍及其杂交组合的测序数据；所有测序序列均通过BWA比对至鲍鱼参考基因组，变异位点的检测采用GATK工具完成。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集包含鲍鱼物种（绿唇鲍、黑唇鲍和杂交种）的基因组测序原始数据和变异发现文件，采用100bp PE Illumina测序技术，通过BWA比对和GATK工具进行变异分析。数据集由CSIRO于2018年发布，主要应用于水产养殖、渔业科学和基因组学研究领域。