AroCageDB

We parsed the Protein Data Bank and thus constructed the Aromatic Cage Database AroCageDB, a database for investigating the binding pocket descriptors and ligand binding space of aromatic-cage-containing proteins (ACCPs). AroCageDB contains 487 unique ACCPs bound to 890 unique ligands, for a total of 1636 complexes.我们对蛋白质数据库（Protein Data Bank）完成数据解析，据此构建了芳香笼数据库（Aromatic Cage Database, AroCageDB）——一款用于研究含芳香笼蛋白质（aromatic-cage-containing proteins, ACCPs）的结合口袋描述符与配体结合空间的专用数据库。该数据库共收录487个独特的含芳香笼蛋白质，这些蛋白分别与890种独特配体结合，总计形成1636个复合物。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

AroCageDB是一个基于蛋白质数据银行（PDB）构建的综合性数据库，专门用于研究含芳香笼蛋白（ACCPs）的结合口袋描述符和配体结合空间。该数据库包含487个独特ACCPs与890个配体形成的1636个复合物，是一个网络资源，由弗莱堡大学药物生物信息学组开发并定期更新。