RiceSuperPIRdb

The Super Pan-genome of Wild & Cultivated Rice Project based on reference-quality de novo long-read assemblies of 251 rice accessions (202 O. sativa, 28 O. rufipogon, 11 O. glaberrima, and 10 O. barthii) aimed to generate a comprehensive and complete super pan-genome, super pan-annotation and super pan-structural-variations (super pan-SVs). To facilitate the applications of these results, we developed the Rice Super Pan-genome Information Resource Database, an interactive web-based browser for the rice super pan-genome.野生与栽培稻超级泛基因组项目基于251份水稻种质材料（202份栽培稻O. sativa、28份普通野生稻O. rufipogon、11份非洲栽培稻O. glaberrima以及10份巴蒂野生稻O. barthii）的参考级从头长读长基因组组装结果，旨在构建兼具全面性与完整性的超级泛基因组、超级泛基因组注释集以及超级泛基因组结构变异（super pan-SVs）。为推动上述研究成果的应用，本项目开发了水稻超级泛基因组信息资源数据库——一款面向水稻超级泛基因组的交互式网页浏览工具。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

RiceSuperPIRdb是一个水稻超级泛基因组信息资源数据库，基于251个水稻种质的长读长组装，旨在提供全面的超级泛基因组、注释和结构变异数据。该数据库包含序列、基因注释、全基因组比对、泛基因组图、变异图和K-mer谱等信息，支持交互式浏览和工具使用，为水稻研究人员提供便捷的数据访问和分析平台。