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Muestra de Cladosporium tenuissimum asociado a la roña en gulupa, en el departamento de Tolima

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DataCite Commons2024-02-28 更新2025-04-16 收录
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https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=agrosavia_fusarium-passiflora
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资源简介:
Se realizo un muestreo para colecta de material vegetal en cultivos comerciales de gulupa en los municipios de Casabianca, Santa Isabel y Rovira (departamento de Tolima). Las muestras vegetales colectadas fueron georreferenciadas, empacadas y rotuladas para su posterior procesamiento e identificación de patógenos en el C.I Nataima. La caracterización macroscópica de Cladosporium sp fue realizada por: medición del crecimiento de la colonia a partir del día 8 y hasta el día 13 después de la siembra en PDA; Adicionalmente, se determinó el color, aspecto y textura de cada aislamiento. La caracterización microscópica de Cladosporium se realizó por mediciones micrométricas asociados a órganos reproductivos asexuales. Inicialmente cada aislamiento del hongo fue llevado a microcultivo, para luego ser observado en microscopio de luz (Zeizz), en el cual fueron medidas el ancho y largo de conidias terminales (AT y LT), intercalares (AI y LI) y ramoconidias (AR y LR). Las mediciones fueron realizadas en 20 estructuras por cada tipo de conidia por aislamiento. La caracterización molecular de los aislamientos de Cladosporium se realizó a partir de la extracción de AND de cultivo puro monospórico de 15 dias para la obtención de biomasa del hongo empleando la metodología de Moslem y colaboradores de 2010, el DNA extraído fue cuantificado con ayuda de un nanodrop one (Thermo Scientific). El ADN extraído de los aislamientos se empleó un fragmento de la región ITS con los siguientes primers ITS1 5’- TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’ ITS2 5’- GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3'. Posteriormente, se visualizaron los productos de PCR mediante corrido electroforético en gel de agarosa al 1.5%. Los productos de PCR fueron enviados al Instituto de Genética de la Universidad Nacional de Colombia para el Servicio de Secuenciación y Análisis Molecular – SsiGMoL. Posteriormente, las secuencias se editaron mediante leer con programas como BioEdit Sequence Alignment Editor y la identificación determinando su porcentaje de identidad nucleotídica usando algoritmo heurístico de Blast, teniendo como base de comparación el NCBI (National Center for Biotechnology Information). Este recurso contiene 1 registro de Cladosporium tenuissimum, tomado en mayo de 2023.
提供机构:
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
创建时间:
2023-09-18
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