LinkProt: A database of proteins with topological links

LinkProt collects information about protein chains and complexes that form links. LinkProt detects deterministic links (with loops closed by cysteine), and determines likelihood of formation of links in networks of protein chains called MacroLinks. Links are presented graphically in an intuitive way, using tools that involves surfaces of minimal area spanned on closed loops. The database presents extensive information about biological functions of proteins with links and enables users to analyze new structures.LinkProt 数据库（LinkProt）收集了参与形成各类连接的蛋白质链与复合物的相关信息。其可检测由半胱氨酸闭合的环结构构成的确定性连接，并可预测被称为MacroLinks的蛋白质链网络中连接形成的可能性。连接结构以直观的图形化方式呈现，所用可视化工具基于闭合环所张成的最小面积曲面原理。该数据库收录了带有连接结构的蛋白质的详尽生物学功能信息，并支持用户对全新蛋白质结构开展分析工作。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

LinkProt是一个专门收集和展示具有拓扑链接的蛋白质链和复合物信息的数据库。它能够检测确定性链接和MacroLinks网络中的链接可能性，并以图形化方式直观呈现，同时提供蛋白质的生物学功能信息，支持用户分析新结构。