The genome of Magnolia hypoleuca provides a new insight into the evolutionary position of magnoliids

We report a chromosome-scale assembly of M.hypoleuca genome by combining Oxford Nanopore sequencing and Hi-C technologies. The 1.7 Gb assembly covers 96.64% of the genome, with contig N50 of 1.71 Mb and containing 36,651 annotated protein-coding genes.

本研究结合牛津纳米孔测序（Oxford Nanopore sequencing）与Hi-C技术，报道了M.hypoleuca基因组的染色体级别组装结果。该组装序列总长1.7 Gb，覆盖96.64%的基因组完整序列，其重叠群N50（contig N50）为1.71 Mb，共注释得到36651个蛋白质编码基因。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集提供了木兰科植物Magnolia hypoleuca的染色体级别基因组组装，通过结合Oxford Nanopore和Hi-C技术实现，覆盖度达96.64%，包含36,651个注释的蛋白质编码基因。数据集旨在研究木兰类植物的进化位置，包含1个样本、3个实验和7个运行，总数据量376.33 GB，于2022年12月发布。