didsr/ssynth_data-test
收藏资源简介:
S-SYNTH是一个开源、灵活的皮肤模拟框架,用于通过数字渲染解剖学启发的多层、多组分皮肤和生长病变模型,快速生成合成皮肤模型和图像。该框架可以生成高度详细的3D皮肤模型和数字渲染的合成图像,涵盖多种人类肤色,并完全控制底层参数和图像形成过程。数据集主要用于增强有限的病人数据集和识别AI性能趋势,适用于皮肤分割任务的训练或测试预训练的AI模型。
S-SYNTH is an open-source, flexible skin simulation framework to rapidly generate synthetic skin models and images using digital rendering of an anatomically inspired multi-layer, multi-component skin and growing lesion model. It allows for generation of highly-detailed 3D skin models and digitally rendered synthetic images of diverse human skin tones, with full control of underlying parameters and the image formation process. The dataset is intended to facilitate augment limited patient datasets and identify AI performance trends, suitable for training or testing pre-trained AI models in dermatologic analysis tasks.
数据集概述:S-SYNTH
- 数据集名称:S-SYNTH (ssynth_data-test)
- 维护方:DIDSR-FDA
- 任务类型:图像分割(Image Segmentation)
- 模态:图像(Image)、文本(Text)
- 格式:Arrow
- 数据规模:约 51.8k 行(训练集),总计文件大小 501 GB
- 标签:医学(medical)
- 依赖库:Datasets
- 许可证:Creative Commons 1.0 Universal License (CC0)
框架与用途
- 框架描述:S-SYNTH 是一个开源、灵活的皮肤模拟框架,通过数字渲染解剖学启发的多层、多组件皮肤和生长病变模型,快速生成合成皮肤模型和图像,支持多种参数变化(如毛发伪影、血分、病变形状、黑色素体分、每像素样本、光照条件)。
- 直接用途:用于评估皮肤病学分析任务中 AI 性能趋势(如皮肤颜色、毛发、病变形状、血分对病变分割性能的影响),可增强有限的患者数据集,用于训练或测试预训练 AI 模型。
- 超出范围用途:不能替代真实患者数据用于性能判定。
数据集结构
- 目录结构:按参数分层组织,路径格式为:
data/synthetic_dataset/output_10k/output/skin_[SKIN_MODEL_ID]/hairModel_[HAIR_MODEL_ID]/mel_[MELANOSOME_FRACTION]/fB_[BLOOD_FRACTION]/lesion_[LESION_ID]/T_[TIMEPOINT]/[LESION_MATERIAL]/hairAlb_[HAIR_ALBEDO]/light_[LIGHT_NAME]/ROT[LESION_ROTATION_VECTOR]_[RANDOM_ANGLE]/ - 文件内容:每个文件夹包含成对的皮肤图像和病变分割掩膜(含裁剪和未裁剪版本),以及裁剪尺寸文件
crop_size.txt。示例文件:image.png、mask.png、cropped_mask.png、crop_size.txt。
偏差、风险与局限性
模拟测试受限于对象模型和采集系统中表示的参数变异性。如果模拟示例未能捕捉真实患者的变异性,则存在误判模型性能的风险。详见论文讨论。
使用方式
可直接下载数据,或通过 Hugging Face 数据加载器访问: python from datasets import load_dataset data_test = load_dataset("didsr/ssynth_data", split="output_10k") print(data_test)
引用
bibtex @article{kim2024ssynth, title={Knowledge-based in silico models and dataset for the comparative evaluation of mammography AI for a range of breast characteristics, lesion conspicuities and doses}, author={Kim, Andrea and Saharkhiz, Niloufar and Sizikova, Elena and Lago, Miguel, and Sahiner, Berkman and Delfino, Jana G., and Badano, Aldo}, journal={International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI)}, volume={}, pages={}, year={2024} }
相关链接
- 代码仓库:https://github.com/DIDSR/ssynth-release




