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单碱基水平定量解析杨树次生木质部表观转录组

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国家林业和草原科学数据中心2022-10-18 更新2024-03-06 收录
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资源简介:
该数据是林木次生生长的分子调控和环境胁迫机制项目论文,数据内容是单碱基水平定量解析杨树次生木质部表观转录组。在杨树次生木质部中定量描述选择性多聚腺苷酸化和m6A修饰的关联,首先检测人工合成的有m6A修饰和无m6A修饰位点周围的Nanopore直接RNA测序输出的原始电流信号,提取其信号均值、中值、标准差及宽度等特征构建XGBoost模型,测试数据集的结果表明其m6A修饰预测精度达97%。
提供机构:
国家林业和草原科学数据中心
创建时间:
2022-10-18
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