Bio-entities_Main

Figshare2020-12-08 更新2026-04-28 收录

生物医学实体

生物网络文本挖掘

数据链接：

https://figshare.com/articles/dataset/Bio-entities_Main/12173991 数据链接链接失效反馈

官方服务：

资源简介：

CSV file containing all types of extracted bio-entities by BioBERT. It correspond to the Table 6 in the article.

创建时间：

2020-12-08

andorei/BioNNE-L

生物医学实体

自然语言处理

BioNNE-L共享任务数据集挑战参与者解决英语和俄语中的生物医学概念归一化（MCN）问题，即将生物医学实体提及映射到统一医学语言系统（UMLS）中的相应概念名称和唯一标识符（CUIs）。数据集包含了来自英语和俄语科学摘要的生物医学实体注释，利用NEREL-BIO数据集的MCN注释。数据集的挑战包括嵌套实体的复杂性和部分术语问题，其中部分俄语术语需要映射到英语词汇表条目。数据集以特定格式提供，可以

Hugging Face2025-03-21 更新120

Text mining results for gene and organism mentions

基因组挖掘

生物医学实体

Text mining results for organism and gene mentions. Data retrieved from Jensenlab (http://download.jensenlab.org/) on May 25th 2020 and filtered to contain only results for mouse, rat, and pig.

Figshare2020-12-03 更新90

DataSheet1_InfersentPPI: Prediction of Protein-Protein Interaction Using Protein Sentence Embedding With Gene Ontology Information.docx

蛋白质相互作用

生物网络文本挖掘

Protein-protein interaction (PPI) prediction is meaningful work for deciphering cellular behaviors. Although many kinds of data and machine learning algorithms have been used in PPI prediction, the pe

NIAID Data Ecosystem50

Nassar2022 - Biosynthetic Gene Cluster (BGC) accession NER model

生物合成基因簇

生物网络文本挖掘

bgc-accession model is a Named Entity Recognition (NER) model that identifies and annotates the accessions of Biosynthetic Gene Clusters (BGCs) in texts.

NIAID Data Ecosystem110

ubffm/2026-04-17_ub_opus_bll_ner_annotation

实体识别

生物医学实体

--- dataset_info: features: - name: doc_id dtype: string - name: line_text dtype: string - name: tokens sequence: string - name: ner_results list: - name: bll_class_id

Hugging Face2026-04-17 更新60

Bio-entities_Main

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