Biase et al

在哺乳动物中何时以及如何做出第一个细胞命运决定仍然是一个悬而未决的问题。使用匹配的姐妹卵裂球的深度单细胞 RNA-seq，我们报告了 10 个 2 细胞和 5 个 4 细胞小鼠胚胎之间高度可重复的卵裂球间差异。卵裂球间基因表达差异主导胚胎间差异和噪音，并且足以将姐妹卵裂球聚集成不同的组。数十个蛋白质编码基因在姐妹卵裂球中表现出可重复的双峰表达（FPKM 的 0 对 1e3-1e6），这不能用随机波动来解释。这些双峰基因之一 Gadd45a 的蛋白质表达表现出明显的卵裂粒间对比。我们将一些双峰 mRNA 表达追踪到胚胎基因组激活，而另一些则追踪到卵裂球特异性 RNA 消耗。卵裂球间的差异产生了比随机噪声可能产生的更强大和更大的共表达基因网络。 4 细胞中高度相关的基因对与显示内细胞团 (ICM) 和滋养外胚层 (TE) 之间差异表达方向相同的基因对重叠。这些数据证实了 2 细胞和 4 细胞小鼠胚胎中卵裂球间差异的假设，并将这些差异与 ICM/TE 差异相关联。