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人核酸去甲基化酶ALKBH1的X-射线成像数据集

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国家基础学科公共科学数据中心2024-03-05 收录
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https://www.nbsdc.cn/general/dataDetail?id=64ef2e13bb16e07b0603aa3d&type=1
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资源简介:
"DNA 6mA修饰在真核生物中参与基因的调控。ALKBH1具有DNA 6mA去甲基化酶活性,具有调节组织发育、性别比例、基因表达等多种作用, 人ALKBH1的异常表达导致了许多发育缺陷和癌症的发生。但ALKBH1特异性识别6mA以及对核酸底物选择性识别的分子机制尚不清楚。 本数据集描写的是人核酸去甲基化酶ALKBH1蛋白的X-射线衍射数据,分别结合配体Mn2+、Mn2+和α-KG,分辨率分别在1.97Å和2.80 Å。揭示Flip1和Flip2区域在DNA结合和底物识别中的作用,发现Flip0 区域在底物识别和酶活性中起重要作用。发展了一种新颖、高通量的去甲基化酶活性分析方法,确认非匹配DNA是ALKBH1的优先底物。提出了ALKBH1与底物的结合模型。本工作有助于理解ALKBH1的底物选择机制和催化机理,为相关疾病的药物设计提供了重要依据。"
提供机构:
中国农业大学
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
该数据集提供了人核酸去甲基化酶ALKBH1蛋白的X-射线衍射数据,分辨率分别为1.97Å和2.80Å,结合了配体Mn2+和α-KG。这些数据用于揭示ALKBH1的底物识别和催化机制,为相关疾病的药物设计提供依据。
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