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HumanTestisDB

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国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-06-14 收录
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https://shalab.njmu.edu.cn/humantestisdb/
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官方服务:
资源简介:
HumanTestisDB is a comprehensive database for human testis, it consists of 46 single-cell sequencing datasets from human testis, covering ages from 6 weeks post-fertilization to 49 years old. After uniform analysis, a total of 131,113 cells were retained and classified into 38 different cell types. HumanTestisDB offers six cell sets, each focusing on critical biological events during spermatogenesis and providing in-depth cell type annotations. HumanTestisDB also elucidates cell-cell interactions within the testicular microenvironment across eight developmental stages, detailing the signaling pathways, receptor-ligand pairs, and the cell types involved in these interactions. In summary, HumanTestisDB provides invaluable insights into testicular transcriptomics and interactions, and serves as a vital tool for further research in reproductive biology.

人类睾丸数据库(HumanTestisDB)是针对人类睾丸的综合性数据库,其收录了46组人类睾丸单细胞测序数据集,样本覆盖受精后6周至49岁的各个发育阶段。经统一标准化分析后,最终保留131113个细胞,并将其划分为38种不同的细胞类型。HumanTestisDB 提供六组细胞数据集,每一组均聚焦精子发生过程中的关键生物学事件,并附带详尽的细胞类型注释信息。此外,该数据库还阐明了八个发育阶段中睾丸微环境内的细胞间互作关系,详细解析了参与这些互作的信号通路、受体-配体对以及相关细胞类型。综上,HumanTestisDB 为睾丸转录组学及细胞互作研究提供了极具价值的视角,同时也为生殖生物学领域的后续研究提供了关键工具。
提供机构:
Nanjing Medical University
创建时间:
2025-06-13
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
HumanTestisDB是一个专注于人类睾丸微环境细胞的单细胞数据库,包含46个数据集、131,113个细胞和48,361个基因,覆盖从6周受精后到49岁的年龄组和8个发育阶段。它提供细胞注释、基因表达分析和细胞相互作用等功能模块,支持睾丸发育和细胞间通讯的研究。
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