PlantRep
收藏国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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资源简介：
Plantrep provides re-annotated repeat sequences of plant using a uniform pipeline. The current version of plantrep contains 206.04Gb of 396,041,410 repeats from 459 species that were divided into 15 clades based on their phylogeny: algae, bryophyte, lycophytes, fern, gymnosperms, ANA (early angiosperms), magnolids, monocots, base eudicots, super rosids, fabids, malvid, super asterids, lamiids, and campanulids. The general characteristics and consensus sequences of repeats of each plant can be browsed and accessed on this website.
提供机构：
Agricultural Genome Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences
创建时间：
2022-04-21
搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
PlantRep是一个植物重复序列数据集，通过统一流程对459个物种的约3960万条重复序列进行重新注释，总数据量为206.04Gb，并按系统发育分为15个进化支。该数据集提供每个植物重复序列的一般特征和共有序列，支持在线浏览和访问，适用于植物基因组重复序列分析研究。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
