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keanec27/Drug_Protein_Interactions|药物蛋白质相互作用数据集
收藏hugging_face2024-05-18 更新2024-06-12 收录
下载链接：
https://hf-mirror.com/datasets/keanec27/Drug_Protein_Interactions
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链接失效反馈资源简介：
该数据集包含药物-靶标相互作用（DTI）的信息，其中每个样本包含一个蛋白质和一个药物的标识符。数据集分为训练集，包含36592个样本，总大小为62190534字节。
该数据集包含药物-靶标相互作用（DTI）的信息，其中每个样本包含一个蛋白质和一个药物的标识符。数据集分为训练集，包含36592个样本，总大小为62190534字节。
提供机构：
keanec27
原始信息汇总
数据集概述
数据集配置名称
- 名称: protein-drug
数据集特征
- 特征名称: id
- 数据类型: int64
- 特征名称: DTI
- 结构:
- 子特征名称: protein
- 数据类型: string
- 子特征名称: drug
- 数据类型: string
- 子特征名称: protein
- 结构:
数据集分割
- 分割名称: train
- 数据大小: 62190534 字节
- 示例数量: 36592
数据集大小
- 下载大小: 8218601 字节
- 数据集总大小: 62190534 字节
AI搜集汇总
数据集介绍
构建方式
在构建keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集时，研究者精心设计了以蛋白质与药物相互作用为核心的数据结构。数据集通过整合大量实验数据，确保每条记录均包含一个唯一的标识符（id），以及详细描述蛋白质（protein）和药物（drug）相互作用的信息。这种结构化的数据组织方式，不仅便于数据的快速检索和分析，也为后续的生物信息学研究提供了坚实的基础。
使用方法
使用keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集时，研究者可以首先通过其唯一的标识符（id）快速定位感兴趣的蛋白质与药物相互作用记录。随后，可以利用数据集提供的详细信息，进行深入的生物信息学分析，如蛋白质功能预测、药物作用机制研究等。此外，数据集的训练集部分特别适合用于开发和验证新的机器学习模型，以提高对蛋白质与药物相互作用的预测精度。
背景与挑战
背景概述
在生物医学领域，药物与蛋白质相互作用（Drug-Protein Interactions, DPI）的研究对于药物发现和开发具有重要意义。keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集由keanec27创建，专注于记录药物与蛋白质之间的相互作用信息。该数据集的核心研究问题在于揭示药物如何与特定蛋白质结合，从而影响其功能。通过提供详细的相互作用数据，该数据集为研究人员提供了一个宝贵的资源，有助于加速新药的研发过程，并对理解药物作用机制提供了新的视角。
当前挑战
尽管keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集在药物与蛋白质相互作用研究中具有重要价值，但其构建和应用过程中仍面临若干挑战。首先，数据集的构建需要精确的实验数据，这要求高度的实验技术和数据处理能力。其次，药物与蛋白质相互作用的复杂性使得数据集的标注和分类变得困难，需要专业的生物医学知识。此外，数据集的规模和多样性也是一大挑战，如何确保数据集能够覆盖尽可能多的药物和蛋白质相互作用，以提高其泛化能力和应用价值，是当前研究的重点。
常用场景
经典使用场景
在药物发现领域，keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集被广泛用于研究药物与蛋白质之间的相互作用。该数据集通过提供详细的蛋白质和药物配对信息，使得研究人员能够深入分析和预测潜在的药物靶点。经典的使用场景包括构建和训练机器学习模型，以预测新药物与特定蛋白质的结合亲和力，从而加速药物筛选和开发过程。
解决学术问题
该数据集解决了药物发现中的关键学术问题，即如何高效且准确地预测药物与蛋白质的相互作用。通过提供大量的实验数据，研究人员可以开发和验证新的计算模型，这些模型能够显著减少实验成本和时间。此外，该数据集还促进了跨学科研究，如生物信息学和计算化学，推动了药物发现领域的技术进步。
实际应用
在实际应用中，keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集被制药公司和研究机构用于优化药物设计和开发流程。通过利用该数据集训练的模型，研究人员可以快速筛选出具有潜在治疗效果的化合物，从而加速新药的上市时间。此外，该数据集还支持个性化医疗的发展，通过预测特定药物对患者蛋白质的作用，实现更精准的治疗方案。
数据集最近研究
最新研究方向
在药物蛋白质相互作用（DTI）领域，keanec27/Drug_Protein_Interactions数据集的最新研究方向主要集中在利用深度学习技术提高预测模型的准确性和效率。随着计算生物学和人工智能的融合，研究人员正探索如何通过图神经网络（GNN）和变分自编码器（VAE）等先进模型，更精确地捕捉药物与蛋白质之间的复杂相互作用。这些研究不仅有助于加速新药的发现过程，还能为个性化医疗提供更精准的药物推荐，从而在生物医学领域产生深远影响。
以上内容由AI搜集并总结生成
数据主题
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
进入经典数据集
热门数据集
LFW
人脸数据集;LFW数据集共有13233张人脸图像，每张图像均给出对应的人名，共有5749人，且绝大部分人仅有一张图片。每张图片的尺寸为250X250，绝大部分为彩色图像，但也存在少许黑白人脸图片。 URL: http://vis-www.cs.umass.edu/lfw/index.html#download
AI_Studio 收录
学生课堂行为数据集 (SCB-dataset3)
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arXiv 收录
RAVDESS
情感语音和歌曲 (RAVDESS) 的Ryerson视听数据库包含7,356个文件 (总大小: 24.8 GB)。该数据库包含24位专业演员 (12位女性，12位男性)，以中性的北美口音发声两个词汇匹配的陈述。言语包括平静、快乐、悲伤、愤怒、恐惧、惊讶和厌恶的表情，歌曲则包含平静、快乐、悲伤、愤怒和恐惧的情绪。每个表达都是在两个情绪强度水平 (正常，强烈) 下产生的，另外还有一个中性表达。所有条件都有三种模态格式: 纯音频 (16位，48kHz .wav)，音频-视频 (720p H.264，AAC 48kHz，.mp4) 和仅视频 (无声音)。注意，Actor_18没有歌曲文件。
OpenDataLab 收录
Med-MAT
Med-MAT是一个包含106个开源医学数据集的视觉问答（VQA）数据集，旨在推动医学多模态大语言模型（MLLMs）的泛化实验和训练。数据集通过将图像-标签对转换为VQA格式，展示了组合泛化（CG）是MLLMs理解未见图像的关键机制。数据集包括106个医学数据集的问答对、53个按模态、解剖区域和任务（MAT）分类的子集的问答对，以及部分数据集的图像下载链接。
huggingface 收录
AIS数据集
该研究使用了多个公开的AIS数据集，这些数据集经过过滤、清理和统计分析。数据集涵盖了多种类型的船舶，并提供了关于船舶位置、速度和航向的关键信息。数据集包括来自19,185艘船舶的AIS消息，总计约6.4亿条记录。
github 收录