ROAD

ROADv2 is a web-based atlas of rice (Oryza sativa) gene expression that switches from microarray to RNA-seq, integrating 328 public datasets spanning anatomy, abiotic/biotic stress, hormone treatment and nutrient starvation. Interactive modules support gene search, co-expression, GO/KEGG enrichment and PPI network visualisation, providing a comprehensive resource for rice functional genomics.

ROADv2是一款基于网页的水稻（Oryza sativa）基因表达图谱数据库，其数据平台已从基因芯片（microarray）升级至RNA测序（RNA-seq），整合了328套涵盖解剖结构、非生物/生物胁迫、激素处理与营养饥饿处理的公开数据集。该数据库配备交互式分析模块，支持基因检索、共表达分析、基因本体（Gene Ontology, GO）/京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）富集分析以及蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）网络可视化，可为水稻功能基因组学研究提供全面的科研资源。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ROADv2是一个专注于水稻功能基因组学的在线表达谱数据库，提供多种分析工具和交互式图谱，支持基因表达搜索、相关性分析和富集分析等功能。该数据库由Kyung Hee University开发，旨在促进水稻功能基因组学研究。