CCAS

Here we present CCAS (Cancer genome Consensus Annotation System, https://ngdc.cncb.ac.cn/ccas/#/home), a one-stop and comprehensive annotation system for the individual patient at multi-omics level. CCAS integrates 20 widely recognized resources in the field to support data annotation of 10 categories of cancers covering 395 subtypes. Data from each resource are manually curated and standardized by using ontology frameworks. CCAS accepts data on single nucleotide variant/insertion or deletion, expression, copy number variation, and methylation level as input files to build a consensus annotation.

本研究介绍了CCAS（癌症基因组共识注释系统，Cancer genome Consensus Annotation System，访问网址：https://ngdc.cncb.ac.cn/ccas/#/home），这是一款面向个体患者的多组学层面一站式综合注释系统。该系统整合了该领域内20项广泛认可的资源，可支持覆盖395个亚型的10类癌症的数据注释。各来源数据均经人工整理质控，并通过本体论框架完成标准化处理。该系统可接收单核苷酸变异、插入或缺失、基因表达、拷贝数变异以及甲基化水平相关数据作为输入文件，以生成共识注释结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CCAS是一个面向个体患者的一站式癌症基因组多组学注释系统。它整合了20个权威资源，支持10类癌症共395亚型的数据注释，并通过人工标准化处理。系统接受单核苷酸变异、表达、拷贝数变异和甲基化水平等数据输入，以构建共识注释。