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VariSNP is a benchmark database suite comprising variation datasets that can be used for developing and testing the performance of variant effect prediction tools.

VariSNP是一套基准数据库套件,涵盖各类变异数据集,可用于开发及测试变异效应预测工具(variant effect prediction tools)的性能。

提供机构:
隆德大学
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VariSNP 数据集图片
背景与挑战
背景概述
VariSNP是一个基于dbSNP构建的基准数据库套件,专门用于开发和测试变异效应预测工具的性能。该数据库通过过滤ClinVar等疾病相关变异,收录了多种功能类别的中性变异数据,包括单核苷酸变异、非编码转录变异等13类数据集。数据最后更新于2017年2月16日,对应dbSNP build 149和GRCh38p7版本。
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