The Chinese Local Salmonella Genome DataBase version 2 (CLSGDB v2)

中国当地沙门氏菌基因组数据库第2版（CLSGDB v2）整合了1962年新生成的沙门氏菌全基因组测序（WGS）数据和来自中国30个省份的6187个公开可用的基因组。覆盖1905年至2022年。共获得7997个高质量基因组，包括164个血清型和295个序列类型（ST）。China Local Salmonella Genomic Database Version 2 (CLSGDB v2) integrates whole genome sequencing (WGS) data of Salmonella newly generated in 1962 and 6,187 publicly available genomes collected from 30 provinces across China. Covering the period from 1905 to 2022, the database ultimately contains 7,997 high-quality genomes, comprising 164 serotypes and 295 sequence types (ST).

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CLSGDB v2是中国最大的沙门氏菌基因组数据库，包含7997个高质量基因组，覆盖1905年至2022年来自30个中国省份的数据，涉及164个血清型和295个序列类型。该数据库用于分析抗菌素耐药性基因、毒力组和移动组，并揭示经济、气候和社会因素对耐药性的影响，旨在支持基因组监测和公共卫生干预。