Codex
收藏知名数据库2026-06-02 收录
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CODEX是一个全面的下一代测序(NGS)实验数据库，提供经过处理和整理的NGS实验数据，包括ChIP-Seq(转录因子和组蛋白)、RNA-Seq、DNase-Seq和ATAC-Seq。该数据库包含三个专业存储库：HAEMCODE(造血细胞)、ESCODE(胚胎干细胞)和完整的CODEX数据库，涵盖1734个公共实验、145个私有实验、292个独特因子和147种独特细胞类型。
CODEX是一个经人工整理、易于理解的下一代测序（next generation sequencing, NGS）实验数据库，涵盖染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）、RNA测序（RNA-seq）、DNase I超敏感位点测序（DNase-seq）与转座酶可及性测序（ATAC-seq）。该数据库收录了来源于小鼠和人类的NGS实验数据。尽管CODEX的核心研究方向为造血作用与胚胎系统，但其数据集覆盖了多种不同的细胞类型。
提供机构：
剑桥大学搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
CODEX是一个精选且功能全面的下一代测序（NGS）实验数据库，涵盖ChIP-seq、RNA-seq、DNase-seq和ATAC-seq等类型，主要针对造血和胚胎系统，但也包括多种细胞类型。它提供小鼠和人类实验数据，并支持通过浏览、搜索等方式访问和处理后的数据。
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