OrganoidDB

OrganoidDB, a comprehensive transcriptome data (microarray, bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq) resource of human and mouse organoids. 16,218 organoid samples were collected and labeled from GEO and ArrayExpress. Other types of sample are also integrated, including primary tissues and cell lines to enable comparisons to be made with organoids.类器官数据库（OrganoidDB）是一套面向人类与小鼠类器官的综合转录组数据资源，涵盖基因芯片（microarray）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）及单细胞RNA测序（single-cell RNA-seq）三类数据。本数据库从基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus，GEO）与阵列表达数据库（ArrayExpress）中收集并标注了16218个类器官样本，同时整合了原代组织、细胞系等其他类型样本，以支持与类器官的对比分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

OrganoidDB是一个全面的类器官转录组数据库，整合了来自GEO和ArrayExpress的16,218个人类和鼠类类器官样本的微阵列、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据。该数据库还包含其他样本类型（如原代组织和细胞系）以支持比较分析，并提供了搜索和浏览功能，用于探索类器官的转录组表达。