LncATLAS

LncATLAS is an easy-to-use web-based visualization tool to obtain quantitative information about subcellular localization of lncRNAs in human cells. Altogether, 6,768 GENCODE-annotated lncRNAs are represented across various compartments of 15 cell lines. In addition, relative concentration index (RCI) is introduced as a useful measure of localization derived from ensemble RNA-seq measurements.LncATLAS是一款简便易用的网页端可视化工具，可用于获取人类细胞内长链非编码RNA（lncRNA）的亚细胞定位定量信息。该工具共收录了经GENCODE注释的6768条长链非编码RNA，覆盖15种细胞系的各类亚细胞区室。此外，该工具引入了相对浓度指数（Relative Concentration Index, RCI），作为一种从整体RNA测序（RNA-seq）检测结果中衍生出的、用于量化RNA亚细胞定位的有效衡量指标。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

LncATLAS是一个基于网页的可视化工具，用于查询人类细胞中长链非编码RNA（lncRNA）的亚细胞定位信息，涵盖6,768个GENCODE注释的lncRNA在15种细胞系中的分布。该工具通过相对浓度指数（RCI）定量展示定位数据，支持用户通过基因名称或ENSEMBL ID进行交互式搜索和可视化分析。