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<strong>Supplemental Table 2</strong>

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DataCite Commons2023-07-23 更新2024-08-18 收录
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<strong>Supplemental Table 2.</strong> <strong>Metabolome of gut lumen and serum.</strong> <strong>A</strong>) Luminal metabolites of the intraluminal stool and paired<strong> B</strong>) serum metabolites from the same mice group as indicated by mouse ID. Using KEGG BRITE hierarchical classification system (Hattori et al., 2010), the comparison between lumen and serum metabolism in <strong>C</strong>) KEGG functional class, <strong>D</strong>) pathways, <strong>E</strong>) modules. List of all functional modules in <strong>F</strong>) lumen and <strong>G</strong>) serum. Metabolome of intraluminal stool performed using CE/MS (capillary electrophoresis-mass spectrometry) (Kawamura et al., 2018; Matsumoto et al., 2014; Sugahara et al., 2017). Annotations of metabolites based on PubChem (Kim et al., 2021), KEGG (Hattori et al., 2010), or HMDB (Wishart et al., 2018).

补充表2. 肠道腔内容物与血清代谢组。A) 肠腔粪便的腔内代谢物,以及与之配对的B) 以小鼠编号标识的同组小鼠的血清代谢物。采用KEGG BRITE层级分类系统(Hattori等,2010),在C) KEGG功能类别、D) 代谢通路、E) 功能模块层面对比肠腔与血清的代谢组特征。F) 肠腔及G) 血清中全部功能模块的列表。肠腔粪便代谢组的检测采用毛细管电泳-质谱联用(CE/MS, capillary electrophoresis-mass spectrometry)技术(Kawamura等,2018;Matsumoto等,2014;Sugahara等,2017)。代谢物注释基于PubChem(Kim等,2021)、KEGG(Hattori等,2010)及HMDB(Wishart等,2018)数据库。

提供机构:
figshare
创建时间:
2023-07-23
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背景与挑战
背景概述
该数据集提供了小鼠肠道内腔粪便和配对血清的代谢组数据,通过CE/MS技术分析,并基于PubChem、KEGG和HMDB进行代谢物注释。它比较了肠道内腔和血清在KEGG功能类、途径和模块上的差异,适用于生物信息学和计算生物学研究,特别是与肠道微生物组相关的代谢分析。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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