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CONREL v2 provides a new collection of consensus promoters, enhancers and active enhancers for XX cell-lines across X tissue types for Mus musculus. The ChIP-seq data has been mapped to GRCm38/mm10 mouse assembly.

CONREL v2 为小家鼠(Mus musculus)中覆盖X种组织类型的XX细胞系提供了一套全新的共识启动子(consensus promoters)、增强子(enhancers)及活性增强子(active enhancers)集合。该数据集配套的染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)数据已比对至GRCm38/mm10小鼠参考基因组装配版本。

提供机构:
University of Trento
搜集汇总
数据集介绍
CONREL 数据集图片
背景与挑战
背景概述
CONREL是一个基因组浏览器,用于探索共识调控元件(如启动子、增强子和活性增强子),并利用转录因子的总结合亲和力进行功能注释。该数据集整合了小鼠(Mus musculus)的ChIP-seq数据,映射到GRCm38/mm10组装,同时提供了多物种(包括人类和小鼠)不同基因组组装版本的数据集合。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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