2023年中国广西北海麦氏偏顶蛤和海南文昌耳偏顶蛤线粒体基因组数据
收藏国家海洋科学数据中心2025-09-12 更新2025-09-13 收录
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http://msdc.qdio.ac.cn/data/metadata-special-detail?id=1965973714944237570&otherId=1965973714948431874
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资源简介：
对麦氏偏顶蛤和耳偏顶蛤构建基因组文库，并在 Illumina NovaSeq 平台上进行测序，测序方式为 2 × 150 bp 双端测序。原始数据经过质量控制后，采用 SPAdes v3.11.0 进行从头组装，获得初步的 contig 与 scaffold 序列。随后利用 Mummer v3.1 与 Pilon v1.18 对组装结果进行缺口填补与纠错，得到完整的线粒体基因组序列。功能注释通过 MITOS2 平台完成，遗传密码选择为无脊椎动物标准。蛋白编码基因（PCGs）的边界由 NCBI ORF Finder 辅助预测，并结合同科物种基因进行人工校正
