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CRC-ICM

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arXiv2023-08-19 更新2024-06-21 收录
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资源简介:
CRC-ICM数据集由伊斯法罕医科大学免疫学系创建,包含1,756张与136名结直肠癌患者相关的免疫细胞标记模式图像。数据集详细记录了患者的临床病理特征,特别关注肿瘤位置,分为左右两侧。创建过程中,从手术切除的组织中获取图像,并使用特定的抗体进行染色。CRC-ICM旨在通过分析肿瘤微环境中的免疫细胞功能,预测疾病的预后和临床结果,特别是在免疫治疗领域具有重要应用价值。

The CRC-ICM dataset was created by the Department of Immunology, Isfahan University of Medical Sciences, and comprises 1,756 images of immune cell marker patterns associated with 136 colorectal cancer patients. The dataset thoroughly documents the clinicopathological characteristics of the patients, with a specific focus on tumor location, which is categorized into left and right sides. During the dataset's construction, images were acquired from surgically resected tissues and stained with specific antibodies. The CRC-ICM dataset aims to predict disease prognosis and clinical outcomes by analyzing immune cell functions within the tumor microenvironment, holding significant application value particularly in the field of immunotherapy.
提供机构:
伊斯法罕医科大学免疫学系
创建时间:
2023-08-19
搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
CRC-ICM数据集的构建基于对结直肠癌(CRC)患者的组织样本进行免疫组化染色。研究团队从伊朗伊斯法罕医科大学附属Al-Zahra医院选取了2013年至2016年间接受手术的CRC患者,确保样本未接受术前化疗且无其他癌症或自身免疫病史。样本经过H&E染色确认病理数据后,进行针对CD3、CD8、CD45RO、PD-1、Tim3和LAG3的免疫组化染色。两位经验丰富的病理学家分别对肿瘤中心(CT)和侵袭边缘(IM)进行图像采集,最终形成包含1756张图像的数据集,涵盖136名患者的详细临床和病理信息。
特点
CRC-ICM数据集的显著特点在于其全面性和细致性。首先,该数据集包含了针对六个关键免疫标记物的免疫组化图像,这些标记物在肿瘤微环境(TME)中具有重要调控作用。其次,图像分别从肿瘤中心和侵袭边缘采集,提供了肿瘤内部和边缘免疫细胞状态的详细视图。此外,数据集还附有患者的临床病理特征,包括肿瘤位置、病理分级等,为研究提供了丰富的背景信息。
使用方法
CRC-ICM数据集适用于多种研究目的,包括但不限于免疫标记物在CRC中的表达模式分析、肿瘤微环境中免疫细胞的功能状态评估以及个性化治疗策略的开发。研究者可以通过分析不同免疫标记物在肿瘤中心和侵袭边缘的表达差异,深入理解肿瘤的免疫微环境。此外,结合患者的临床病理数据,可以进行多因素分析,预测患者的预后和治疗反应。数据集的公开访问为全球研究者提供了宝贵的资源,有助于推动CRC相关研究的进展。
背景与挑战
背景概述
结直肠癌(CRC)是全球第二大常见癌症死亡原因,其发病率和死亡率在全球范围内呈上升趋势。CRC-ICM数据集由伊朗伊斯法罕医科大学和设拉子医科大学的研究人员于2013年至2016年间创建,旨在通过分析肿瘤微环境(TME)中的免疫细胞标记物来预测CRC的预后和临床结果。该数据集包含了136名CRC患者的1756张免疫组化染色图像,涵盖了CD3、CD8、CD45RO、PD-1、Tim3和LAG3等关键免疫标记物。这些图像分别从肿瘤的侵袭边缘(IM)和中心(CT)获取,提供了对TME中免疫细胞功能状态的深入理解。CRC-ICM数据集的发布为CRC的个性化治疗和预后预测提供了宝贵的资源,推动了免疫疗法和精准医学的发展。
当前挑战
CRC-ICM数据集在构建过程中面临多项挑战。首先,获取高质量的免疫组化染色图像需要精确的技术和经验丰富的病理学家,以确保图像的准确性和一致性。其次,肿瘤内部异质性导致不同区域(如IM和CT)的免疫细胞分布和功能状态存在显著差异,这增加了数据分析的复杂性。此外,数据集中的患者信息多样,包括不同的肿瘤位置、病理分期和临床特征,这要求研究者在分析时考虑多重变量,以避免偏差。最后,尽管CRC-ICM数据集提供了丰富的免疫标记物信息,但其在大规模临床应用中的有效性和可靠性仍需进一步验证,特别是在不同种族和地理区域的患者群体中。
常用场景
经典使用场景
CRC-ICM数据集在结直肠癌(CRC)研究中具有经典应用场景,主要用于分析肿瘤微环境(TME)中的免疫细胞标记物模式。通过提供高质量的免疫组化(IHC)图像,该数据集允许研究人员深入探讨CD3、CD8、CD45RO、PD-1、Tim3和LAG3等关键免疫标记物在肿瘤中心(CT)和侵袭边缘(IM)的表达差异。这种细致的分析有助于揭示不同肿瘤区域的免疫细胞浸润模式,从而为个性化治疗策略提供依据。
实际应用
CRC-ICM数据集在实际应用中具有广泛潜力,特别是在临床诊断和治疗决策中。通过分析数据集中的免疫标记物表达模式,临床医生可以更准确地评估患者的免疫状态和预后,从而制定个性化的治疗方案。此外,该数据集还可用于训练和验证机器学习算法,以开发自动化诊断工具,提高病理分析的效率和准确性。这些应用有助于提升结直肠癌患者的治疗效果和生活质量。
衍生相关工作
CRC-ICM数据集的发布催生了一系列相关研究工作,特别是在免疫标记物与结直肠癌预后和治疗反应之间的关系研究中。例如,基于该数据集的研究揭示了PD-1、Tim3和LAG3等抑制性免疫检查点在肿瘤微环境中的重要作用,为开发新的免疫治疗策略提供了理论基础。此外,该数据集还促进了多中心合作研究,推动了全球范围内结直肠癌免疫微环境的标准化分析和比较研究。
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