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zgcarvalho/oas-test

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Hugging Face2023-09-28 更新2024-03-04 收录
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资源简介:
--- license: cc-by-4.0 size_categories: 10M<n<100M pretty_name: Observed Antibody Space config_names: - paired - unpaired tags: - biology - protein dataset_info: - config_name: paired features: - name: sequence_heavy dtype: string - name: sequence_light dtype: string - name: cdr1_heavy dtype: string - name: cdr2_heavy dtype: string - name: cdr3_heavy dtype: string - name: fwr1_heavy dtype: string - name: fwr2_heavy dtype: string - name: fwr3_heavy dtype: string - name: fwr4_heavy dtype: string - name: cdr1_light dtype: string - name: cdr2_light dtype: string - name: cdr3_light dtype: string - name: fwr1_light dtype: string - name: fwr2_light dtype: string - name: fwr3_light dtype: string - name: fwr4_light dtype: string - name: species dtype: string - name: vaccine dtype: string - name: disease dtype: string splits: - name: train num_bytes: 985822519 num_examples: 1777462 download_size: 0 dataset_size: 985822519 - config_name: unpaired features: - name: sequence dtype: string - name: chain dtype: string - name: cdr1 dtype: string - name: cdr2 dtype: string - name: cdr3 dtype: string - name: fwr1 dtype: string - name: fwr2 dtype: string - name: fwr3 dtype: string - name: fwr4 dtype: string - name: species dtype: string - name: vaccine dtype: string - name: disease dtype: string splits: - name: train num_bytes: 4671469078 num_examples: 15925303 download_size: 0 dataset_size: 4671469078 configs: - config_name: paired data_files: - split: train path: paired/train-* - config_name: unpaired data_files: - split: train path: unpaired/train-* --- # Dataset Card for Observed Antibody Space ## Dataset Description - **Homepage:** - **Repository:** - **Paper:** - **Leaderboard:** - **Point of Contact:** ### Dataset Summary [More Information Needed] ### Supported Tasks and Leaderboards [More Information Needed] ### Languages [More Information Needed] ## Dataset Structure ### Data Instances [More Information Needed] ### Data Fields [More Information Needed] ### Data Splits [More Information Needed] ## Dataset Creation ### Curation Rationale [More Information Needed] ### Source Data #### Initial Data Collection and Normalization [More Information Needed] #### Who are the source language producers? [More Information Needed] ### Annotations #### Annotation process [More Information Needed] #### Who are the annotators? [More Information Needed] ### Personal and Sensitive Information [More Information Needed] ## Considerations for Using the Data ### Social Impact of Dataset [More Information Needed] ### Discussion of Biases [More Information Needed] ### Other Known Limitations [More Information Needed] ## Additional Information ### Dataset Curators [More Information Needed] ### Licensing Information [More Information Needed] ### Citation Information [More Information Needed] ### Contributions [More Information Needed]

许可证:CC BY 4.0 样本量范围:1000万 < 样本量 < 1亿 数据集简称:观测抗体空间(Observed Antibody Space) 配置名称: - 配对型(paired) - 非配对型(unpaired) 标签: - 生物学 - 蛋白质 数据集信息: - 配置名称:配对型(paired) 特征字段: - 重链序列(sequence_heavy):字符串类型 - 轻链序列(sequence_light):字符串类型 - 重链CDR1区(cdr1_heavy):字符串类型 - 重链CDR2区(cdr2_heavy):字符串类型 - 重链CDR3区(cdr3_heavy):字符串类型 - 重链FR1区(fwr1_heavy):字符串类型 - 重链FR2区(fwr2_heavy):字符串类型 - 重链FR3区(fwr3_heavy):字符串类型 - 重链FR4区(fwr4_heavy):字符串类型 - 轻链CDR1区(cdr1_light):字符串类型 - 轻链CDR2区(cdr2_light):字符串类型 - 轻链CDR3区(cdr3_light):字符串类型 - 轻链FR1区(fwr1_light):字符串类型 - 轻链FR2区(fwr2_light):字符串类型 - 轻链FR3区(fwr3_light):字符串类型 - 轻链FR4区(fwr4_light):字符串类型 - 物种来源(species):字符串类型 - 疫苗关联信息(vaccine):字符串类型 - 疾病关联信息(disease):字符串类型 数据集划分: - 训练集(train):数据字节数985822519,样本数量1777462 下载大小:0 数据集总大小:985822519 - 配置名称:非配对型(unpaired) 特征字段: - 氨基酸序列(sequence):字符串类型 - 链类型(chain):字符串类型 - CDR1区(cdr1):字符串类型 - CDR2区(cdr2):字符串类型 - CDR3区(cdr3):字符串类型 - FR1区(fwr1):字符串类型 - FR2区(fwr2):字符串类型 - FR3区(fwr3):字符串类型 - FR4区(fwr4):字符串类型 - 物种来源(species):字符串类型 - 疫苗关联信息(vaccine):字符串类型 - 疾病关联信息(disease):字符串类型 数据集划分: - 训练集(train):数据字节数4671469078,样本数量15925303 数据集总大小:4671469078 配置项: - 配置名称:配对型(paired),数据文件: - 训练集划分:路径为paired/train-* - 配置名称:非配对型(unpaired),数据文件: - 训练集划分:路径为unpaired/train-* # 观测抗体空间(Observed Antibody Space)数据集卡片 ## 数据集描述 - **主页:** - **代码仓库:** - **相关论文:** - **排行榜:** - **联系人:** ### 数据集概述 [需提供更多信息] ### 支持任务与排行榜 [需提供更多信息] ### 语言 [需提供更多信息] ## 数据集结构 ### 数据实例 [需提供更多信息] ### 数据字段 [需提供更多信息] ### 数据集划分 [需提供更多信息] ## 数据集构建 ### 构建依据 [需提供更多信息] ### 源数据 #### 初始数据收集与标准化处理 [需提供更多信息] #### 数据来源生产者是谁? [需提供更多信息] ### 标注信息 #### 标注流程 [需提供更多信息] #### 标注人员是谁? [需提供更多信息] ### 个人与敏感信息 [需提供更多信息] ## 数据使用注意事项 ### 数据集的社会影响 [需提供更多信息] ### 偏差讨论 [需提供更多信息] ### 其他已知局限性 [需提供更多信息] ## 附加信息 ### 数据集维护者 [需提供更多信息] ### 许可信息 [需提供更多信息] ### 引用信息 [需提供更多信息] ### 贡献内容 [需提供更多信息]
提供机构:
zgcarvalho
原始信息汇总

数据集卡片 for Observed Antibody Space

数据集描述

数据集概要

该数据集名为“Observed Antibody Space”,包含两个配置:pairedunpaired。数据集大小介于10M到100M之间,采用CC BY 4.0许可。

支持的任务和排行榜

[更多信息需要]

语言

[更多信息需要]

数据集结构

数据实例

[更多信息需要]

数据字段

paired 配置

  • sequence_heavy: 字符串类型
  • sequence_light: 字符串类型
  • cdr1_heavy: 字符串类型
  • cdr2_heavy: 字符串类型
  • cdr3_heavy: 字符串类型
  • fwr1_heavy: 字符串类型
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  • fwr4_light: 字符串类型
  • species: 字符串类型
  • vaccine: 字符串类型
  • disease: 字符串类型

unpaired 配置

  • sequence: 字符串类型
  • chain: 字符串类型
  • cdr1: 字符串类型
  • cdr2: 字符串类型
  • cdr3: 字符串类型
  • fwr1: 字符串类型
  • fwr2: 字符串类型
  • fwr3: 字符串类型
  • fwr4: 字符串类型
  • species: 字符串类型
  • vaccine: 字符串类型
  • disease: 字符串类型

数据分割

paired 配置

  • train 分割
    • 字节数: 985822519
    • 样本数: 1777462

unpaired 配置

  • train 分割
    • 字节数: 4671469078
    • 样本数: 15925303

数据集创建

策划理由

[更多信息需要]

源数据

初始数据收集和规范化

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源语言生产者是谁?

[更多信息需要]

注释

注释过程

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注释者是谁?

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个人和敏感信息

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使用数据集的考虑因素

数据集的社会影响

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讨论偏见

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其他已知限制

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附加信息

数据集策展人

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许可信息

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引用信息

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贡献

[更多信息需要]

搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
This dataset contains antibody sequence data, including paired and unpaired sequences with annotations for heavy and light chains, CDR regions, and species information. It is primarily focused on biological research, particularly related to SARS-COV-2, and is available in parquet format under a cc-by-4.0 license.
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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